У меня была подобная проблема, один к одному. Сейчас иногда тоже возникает. У меня старенькая звуковуха Audigy 2, встроенной не пользуюсь. Приходится перевтыкать ее в слот. Но проблема не в слоте PCI, а в самой карте, возможно повреждена контактная полоса, сейчас работает нормально.