Нет, суббоеприпасы у них одинаковые (по 247 Mk 118, правда могут в обоих быть разные взрыватели как Mod 0, так и Mod 1), отличаются корпусом (CBU-99 имеет термозащиту, у Мк-20 термозащита пошла только с версии Mod 6) и механизмом рассеивания боеприпасов (у CBU-99 - SUU-75/B или есть еще вариант 75А/В, у Мк-20 соответственно Mk7 в различных модификациях, всего, если не ошибаюсь 10-12 разновидностей). В плане применения оба однотипны, разницы не заметил, да, тяжелую технику поражают, если пачку их сбросить (не менее 4, а лучше 8-10), достаточно точные при работе по колонне для неуправляемых боеприпасов, хотя и пехоту косят тоже на ура, там уже достаточно одной таблетки.