Yo tengo un problema similar, que aparece de forma muy ocasional. En mi caso son tirones periódicos (cada segundo o así) relacionados con picos de acceso al disco duro C. Lo extraño es que tanto DCS, como las partidas guardadas, como el archivo de paginación los tengo en el disco E, y ambos son discos SSD. Solo se me soluciona reiniciando.
No sé muy bien la causa de estos tirones periódicos, pero en mi caso creo que podría ser algo relacionado con un exceso de carga en uno de los núcleos del procesador. Con el programa HWinfo me di cuenta de que DCS utilizaba casi al 100% el núcleo 0 del procesador, mientras que los otros apenas tenían uso. Con el programa Process Lasso quité la afinidad de DCS con el núcleo 0 y la dejé en los núcleos 1, 2 y 3, y el rendimiento ha mejorado de forma considerable. Antes me parecía que el Process Lasso era un camelo, pero sí que me ha funcionado.