На самом деле все решается.
Те моды который хотят получить официальное одобрение отправляются разработчикам и если всех все устраивает, то выпускается единый мод (платный, бесплатный это не главное) Тем модером, чьи работы не прошли но достойны внимания можно направить замечания по доработке.
Те сервера которые рассчитаны на боевые действия и со строгой проверкой устанавливают исключительно одобренный (официальный) мод с допкрафтами
Сервера как наш например который исключительно для пилотажа (и нам фиолетово накручено что то у посетителя или нет) ставят моды какие хотят и люди которые хотят летать у нас ставят любые моды.
И все! если человек серьезно заморочен боевой составляющей, то он продолжает ходить на боевые сервера на которых установлен "официальный" мод который будет так же проверяться при общей проверке при подключению к серверу.
З.Ы. Не по теме вопрос:
а выделенную часть сервера сделать для ЛО совсем не реально не переписывая всю игру или все же возможно? Может найдется умелец...