По триггерам - можно попытаться заставить игрока следовать логике, контролировать последовательность флагами. Понятно, что геморрой, но ведь поможет...
По сложности - как вариант делать два-три варианта миссии с разной степенью сложности, опять-таки дополнительная работа...