Предполагаю что так происходит потому что каждая операция генерит прерывание, посмотрите в top значения wa, hi и si. Дистрибутив не имеет значения, это на уровне ядра обрабатывается, а оно везде примерно одинаковое.
Кстати да, интересно было бы послушать мнения эксплуатантов. На Mac'ах это работает настолько красиво что покупать систему с чистыми SSD вообще не имеет смысла, по крайней мере на моих задачах.